3重の壁に覆われ巨人から身を潜めて生きていた人類だが、5年前に突如やってきた超大型巨人と鎧の巨人に、一番外の壁に穴を空けられたくさんの巨人がなだれ込んできた。人類が住む敷地が2/3になり、エレン達調査兵団は、街を取り戻すため、空けられた壁の穴を…